当加工厂老板逃跑时，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
保持冷静，积极应对
保持冷静，避免自乱阵脚。
保持积极乐观的心态，相信事情会有转机。
注意取证，依法维权
及时收集证据，如工资条、劳动合同、社保缴费记录等。
必要时可以报警，通过法律途径维护自己的合法权益。
多方求助，争取补偿
通过工会、劳动部门等渠道反映情况，争取补偿。
地方政府可能会出面协调，设立专项基金帮助员工渡过难关。
报警并联系劳动部门
工厂经营者逃逸后，员工应立即报警并联系人力资源与社会保障局投诉。
如果协调无果，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，拒不履行者可申请法院强制执行。
有欠条者可向法院申请支付令。
申请劳动仲裁和支付令
劳动者可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
对于持有欠条证据的案件，当事人可向当地人民法院提交支付令申请。
搜集证据
搜集劳动关系存在的相关证据，如工资条、打卡记录、考勤簿、工服、工作往来信息、证人证言、录音等。
这些证据将有助于后续的维权工作。
申请破产清算
公司倒闭且老板逃跑时，债权人可以向人民法院申请破产。
人民法院受理破产申请后，由管理人清算公司财产，并按照法律规定进行债务清偿。
寻求政府和媒体帮助
请求当地政府和媒体帮助解决，以增加解决问题的可能性。
通过以上措施，员工可以依法维护自己的合法权益，争取应得的补偿和赔偿。